El Laboratorio de Tecnología de Productos Pecuarios, ubicado en el Campus Puerto Escondido, se encuentra adscrito al Instituto de Industrias y tiene como finalidad el desarrollo de investigación, prácticas de laboratorio para los estudiantes de la Licenciatura en Zootecnia, cursos de capacitación a productores y estancias profesionales a estudiantes de otras universidades.
Dentro de las instalaciones del laboratorio se desarrollan tesis en el área de estudio de la carne y productos cárnicos en la evaluación de características fisicoquímicas y tecnológicas. Para ello, se cuenta con instrumentos de medición del color, pH, conductividad eléctrica, CRA y pérdida por goteo.
Las prácticas de laboratorio en tecnología de carnes que llevan los estudiantes están relacionadas con las características fisicoquímicas de la carne y leche, la conversión de músculo a carne, métodos de conservación de productos cárnicos, así como el envasado y la preservación de nuevos productos cárnicos, curados secos, curados crudos, elaboración de productos lácteos, entre otros.
También se desarrollan prácticas en leche y productos lácteos donde se estudian las características físicas y químicas para medir la calidad y la pasteurización. Con ello, se elaboran una variedad de quesos y productos como yogurt, cajeta, chongos zamoranos, entre otros.
Dentro de los cursos de capacitación a productores, comunidades y ranchos ganaderos de la región están la elaboración de quesillo, cajeta y queso panela.